上海國際航運研究中心于2008年7月14日正式成立，上海市委副書記、市長韓正發來賀信，交通運輸部副部長徐祖遠、上海市副市長沈駿共同揭牌。研究中心由上海海事大學、虹口區人民政府等10多家單位共同發起，經上海市教育委員會批準，得到上海市建設和交通委員會支持。2014年被列入上海高校人文社會科學重點研究基地建設計劃。
